常見問題
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【知識科(kē)普】核酸提取的常用(yòng)方法及原理(lǐ)
目前常用(yòng)的核酸提取方法有(yǒu)兩種:一種是柱式提取,另一種是磁珠法提取。其中(zhōng)自動化提取的實現主要依賴于磁珠法。
柱式提取是用(yòng)于微量核酸提取的較為(wèi)簡單的方法,屬于矽吸附方法的一種,市場上的離心柱雖各有(yǒu)特色,但在原理(lǐ)上通常可(kě)分(fēn)為(wèi)三個部分(fēn):
(1)利用(yòng)裂解液促使細胞破碎,使細胞中(zhōng)的核酸釋放出來。
(2)把釋放出的核酸特異地吸附在特定的矽載體(tǐ)上,這種載體(tǐ)隻對核酸有(yǒu)較強的親和力和吸附力,對其他(tā)生化成分(fēn)如蛋白質(zhì)、多(duō)糖、脂類則基本不吸附,因而在離心時被甩出柱子。
(3)把吸附在特異載體(tǐ)上的核酸用(yòng)洗脫液洗脫下來,分(fēn)離得到純化的核酸。
(柱式法圖解)
磁珠法提取運用(yòng)納米技(jì )術對超順磁性納米顆粒的表面進行改良和表面修飾後,制備成超順磁性氧化矽納米磁珠。該磁珠能(néng)在微觀界面上與核酸分(fēn)子特異性地識别和高效結合。利用(yòng)氧化矽納米微球的超順磁性,在Chaotropic鹽(鹽酸胍、異硫氰酸胍等)和外加磁場的作(zuò)用(yòng)下,能(néng)從血液、動物(wù)組織、食品、病原微生物(wù)等樣本中(zhōng)的DNA和RNA分(fēn)離出來,可(kě)應用(yòng)在臨床疾病診斷、輸血安(ān)全、法醫(yī)學(xué)鑒定、環境微生物(wù)檢測、食品安(ān)全檢測、分(fēn)子生物(wù)學(xué)研究等多(duō)種領域。
(機器自動化磁珠法圖解)
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【核酸提取常見問題】核酸提取量過少是什麽原因導緻的?如何解決?
核酸提取量過少,主要原因及解決措施如下:
原因一:實驗材料不佳或量少。
解決方法:盡量選用(yòng)新(xīn)鮮(幼嫩)的材料。
原因二:材料破壁或裂解不充分(fēn)。
解決方法:動植物(wù)要勻漿研磨充分(fēn);G+菌、酵母裂解前先用(yòng)生物(wù)酶或機械方式破壁;高溫裂解時,時間适當延長(cháng)(對于動物(wù)細胞、細菌可(kě)增加PK的用(yòng)量)。
原因三:沉澱不完全。
解決方法:(1)低溫沉澱,延長(cháng)沉澱時間。(2)加輔助物(wù),促進沉澱。
原因四:洗滌時DNA丢失。
解決方法:洗滌時,最好用(yòng)槍頭将洗滌液吸出,勿傾倒。
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【核酸提取常見問題】DNA降解是什麽原因導緻的?如何避免?
DNA降解,主要原因及解決方法如下:
原因一:材料不新(xīn)鮮或反複凍融。
解決方法:盡量取新(xīn)鮮材料,低溫保存材料避免反複凍融。
原因二:未很(hěn)好抑制内源核酸酶的活性。
解決方法:(1)液氮研磨或勻漿組織後,應站在解凍前加入裂解緩沖液。
(2)在提取内源核酸酶含量豐富的材料的DNA時,可(kě)增加裂解液中(zhōng)螯合劑的含量。
原因三:提取過程操作(zuò)過于劇烈,DNA被機械打斷。
解決方法:細胞裂解後的後續操作(zuò)應盡量輕柔。
原因四:被外源核酸酶污染。
解決方法:所有(yǒu)試劑用(yòng)無菌水配制,耗材經高溫滅菌。
原因五:反複凍融。
解決方法:将DNA分(fēn)裝(zhuāng)保存在緩沖液中(zhōng),避免反複凍融。
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【PCR實驗常見問題】無擴增産(chǎn)物(wù)(假陰性)的可(kě)能(néng)原因及解決方法有(yǒu)哪些?
無擴增産(chǎn)物(wù)(假陰性)的可(kě)能(néng)原因及解決方法一覽表
序号
可(kě)能(néng)原因
解決方法
1
模闆含有(yǒu)抑制物(wù)或模闆含量低
純化模闆或者使用(yòng)試劑盒提取模闆DNA或加大模闆的用(yòng)量
2
Buffer對樣品不合适
更換Buffer或調整濃度
3
引物(wù)設計不當或者發生降解
重新(xīn)設計引物(wù)(避免鏈間二聚體(tǐ)和鏈内二級結構)或者換一管新(xīn)引物(wù)
4
反應條件:退火溫度太高,延伸時間太短
降低退火溫度、延長(cháng)延伸時間
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【PCR實驗常見問題】為(wèi)何空白對照會出現目的擴增産(chǎn)物(wù)(假陽性)?如何避免?
空白對照出現目的擴增産(chǎn)物(wù),屬于出現了靶序列或擴增産(chǎn)物(wù)的交叉污染,為(wèi)避免這種情況發生,應注意以下幾點:
(1)實驗操作(zuò)時小(xiǎo)心輕柔,防止将靶序列吸入加樣槍内或濺出離心管外。
(2)除酶及不能(néng)耐高溫的物(wù)質(zhì)外,所有(yǒu)試劑或器材均應高壓消毒。所用(yòng)離心管及加樣槍頭等均應一次性使用(yòng)。
(3)各種試劑最好先進行分(fēn)裝(zhuāng),然後低溫貯存。
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【ELISA實驗常見問題】試驗結果白闆,而且陽性對照不顯色,可(kě)能(néng)原因及解決方法有(yǒu)哪些?
試驗結果白闆,而且陽性對照不顯色,常見原因以及解決方法如下:
(1)可(kě)能(néng)原因:漏加或者誤加試劑;
解決方法:檢查試驗記錄和剩餘試劑。每次加液前均應核對标簽。
(2)可(kě)能(néng)原因:試劑過期;
解決方法:使用(yòng)有(yǒu)效期内的産(chǎn)品。
(3)可(kě)能(néng)原因:洗闆液配制中(zhōng)出現問題,如量筒不幹淨含HRP酶抑制物(wù)(疊氮鈉等);
解決方法:使用(yòng)幹淨的器皿,正确配制試劑。
(4)可(kě)能(néng)原因:溫育的時間或溫度不夠;
解決方法:校正溫育箱溫度。
(5)可(kě)能(néng)原因:标準品失活或者丢失;
解決方法:标準品正确保存、溶解和混勻。
(6)可(kě)能(néng)原因:抗體(tǐ)失活或者丢失;
解決方法:更換抗體(tǐ)或者提高抗體(tǐ)濃度。
(7)可(kě)能(néng)原因:酶失活或者丢失;
檢查方法:把工(gōng)作(zuò)濃度的酶再稀釋20-100倍,取5uL加入50ul的顯色底物(wù),終止後顯色是否能(néng)達到1.0左右,此為(wèi)酶的粗略估計。
解決方法:更換酶或者提高酶的濃度。
(8)可(kě)能(néng)原因:顯色底物(wù)失活;
檢查方法:加少量的工(gōng)作(zuò)濃度的酶,TMB是否很(hěn)快顯色。
解決辦(bàn)法:更換顯色底物(wù)。
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【ELISA實驗常見問題】實驗結果空白背景高,是什麽原因造成的?如何解決?
ELISA實驗結果空白背景高,常見原因如下:
(a)可(kě)能(néng)原因:洗闆不幹淨;
解決方法:充分(fēn)洗滌,徹底拍幹;洗闆要防止交叉污染;濃縮洗液準确配制;吸嘴盡可(kě)能(néng)一次性使用(yòng);加樣或加酶拍闆的濾紙應棄去不用(yòng),不要反複使用(yòng),否則易造成污染。
(b)可(kě)能(néng)原因:顯色液變質(zhì)或者試劑過期;
解決方法:檢查試劑盒有(yǒu)效期。
(c)可(kě)能(néng)原因:試劑稀釋有(yǒu)誤,如加酶的濃度過高;
解決方法:請按說明書所示稀釋倍數配制;
(d)可(kě)能(néng)原因:蒸餾水受酶等污染;
解決方法:使用(yòng)新(xīn)鮮蒸餾水。
(e)可(kě)能(néng)原因:試劑混用(yòng);
解決方法:不同批号試劑勿混用(yòng)。
(f)可(kě)能(néng)原因:培養箱溫度超過37℃或反應時間過長(cháng);
解決方法:顯色反應時間适當縮短。